Kiến trúc bảo mật của Alien được thiết kế để cung cấp mức độ bảo mật và bảo vệ quyền riêng tư cao nhất trong liên lạc. Bằng cách kết hợp mã hóa đầu cuối, mã hóa trên chuỗi và cơ chế bảo vệ nhiều lớp, Alien đảm bảo dữ liệu người dùng được bảo vệ khỏi truy cập và giả mạo trái phép trong quá trình truyền và lưu trữ. Kiến trúc bảo mật của Alien bao gồm các phần chính sau: